Program Studi Manajemen Informatika mulai diselenggarakan tahun 1997 berdasarkan Keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan No. 045/D/O/1997 tanggal 1 Agustus 1997 dan bernaung di bawah Sekolah Tinggi Manajemen Informatika dan Komputer (STMIK) MIKROSKIL di Medan. Program Studi ini dikelola oleh seorang Ketua dan Sekretaris yang didukung oleh Unsur Pelaksana Administrasi Akademik, Unsur Pelaksana Administrasi Umum dan Keuangan, Bagian Administrasi Kemahasiswaan, Perpustakaan, Pusat Penelitian dan Pengabdian Pada Masyarakat, Unit Pelaksana Teknis Laboratorium Komputer dan Pembelajaran Elektronik, serta Pusat Sistem Informasi.

Pada tahun 2002, status Program Studi telah terakreditasi dengan Peringkat Akreditasi B berdasarkan Surat Keputusan Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi Nomor 004/BAN-PT/Ak-I/Dpl-III/IV/2002 tertanggal 15 April 2002.

Pada tahun 2007 Program Studi telah direakreditasi dengan Nomor 017/BAN-PT/Ak-VII/Dpl-III/XII/2007 tertanggal 29 Desember 2007 dengan Peringkat Akreditasi B.